物によりますが、使えるだけ使うと言うのが良いでしょう。
せっかく繁殖したバクテリアを捨ててしまう事になりますので、使える所まで使いましょう。
濾材には、セラミック性の物があります。寿命的にはかなり長いと思います。こちらは壊れる迄使えます。使っていくとばらばらになりますが、形のあるものはそのまま継続的に使用できます。
大磯等の砂利を使用するものについては、ほぼ半永久的に使えると思います。
また、プラスチックや綿?等の材質の物もあります。これについては使った事ありませんが、それなりに長期間使用できると思います。
個人的には、前者のセラミック製で多孔質の物が濾過能力的にお勧めします。